在办理土地使用证时，土地出让金的计算方式是

土地出让金计算有标准，依据法规《城镇国有土地使用权出让和转让暂行条例》。未及时处理可能导致无法合法拥有土地使用权，影响房产权益。
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处理土地出让金计算，常见方式有按基准地价、评估价或成交价计算。具体选择需根据土地取得方式和实际成交情况确定。
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土地出让金计算方式多样。操作如下：1.划拨土地，按基准地价40%算；2.委托估价，按评估价40%算；3.成交价不低于基准地价，按40%算；4.成交价低，则按全部地价40%算。